مسئولیت اجرای حکمهای کیفری – یعنی پیگیری و عملی کردن حکمی که دادگاه صادر کرده – به طور کلی بر عهده دادستان است. اما در مناطقی که رئیس قوه قضاییه تشخیص دهد، واحدی به نام «معاونت اجرای احکام کیفری» در دادسرا زیر نظر مستقیم دادستان این کار را انجام میدهد. این معاونت میتواند در صورت لزوم بخشهای تخصصی جداگانهای برای انواع مختلف احکام داشته باشد. در مواردی که رئیس قوه قضاییه تصویب کند، خود معاونت یا یکی از واحدهایش میتواند داخل زندان یا موسسه کیفری مستقر شود. چگونگی این استقرار و شرح وظایفشان بر اساس آیین نامهای است که وزیر دادگستری با همکاری رئیس سازمان زندانها تهیه میکند و به تصویب رئیس قوه قضاییه میرسد. در حوزه قضایی بخش که دادسرا وجود ندارد، اجرای احکام به عهده رئیس دادگاه بخش است و اگر او نباشد، دادرس علیالبدل (قاضی جانشین) این وظیفه را بر عهده میگیرد.